Τα τμήματα σκοπό έχουν να αναδείξουν επιστήμονες ικανούς να ασχοληθούν με την παραγωγή, την έρευνα, τον πειραματισμό, τον έλεγχο και κυρίως με την διάθεση φαρμάκων και φαρμακευτικών σκευασμάτων σύμφωνα με τις ιατρικές συνταγές.

Τα μαθήματα κάθε έτους διδάσκονται σε 2 εξάμηνα και διακρίνονται σε υποχρεωτικά και υποχρεωτικής επιλογής. Η εκπαίδευση των φοιτητών γίνεται με τις παραδόσεις των θεωρητικών μαθημάτων, τις φροντιστηριακές ασκήσεις και τις εργαστηριακές ασκήσεις. Πολλά από τα μαθήματα συνοδεύονται από πρακτική άσκηση των φοιτητών σε ειδικά εργαστήρια. Η άσκηση των φοιτητών σε αυτά είναι υποχρεωτική. Στο 9ο εξάμηνο θα πρέπει να κάνουν πρακτική άσκηση επί ένα έτος (4 τρίμηνα) σε Φαρμακείο ανοιχτό για το κοινό (τουλάχιστον 3 μήνες), σε Φαρμακείο Φαρμακευτικής Υπηρεσίας Νοσοκομείου (τουλάχιστον επί 3 μήνες) και σε Φαρμακοβιομηχανία (προαιρετικά).

1ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Ανατομία του Ανθρώπου, Ανόργανη Χημεία Ι, Φαρμακευτική Νομοθεσία και Δεοντολογία, Γενικά Μαθηματικά, Γενική Φυσική, Ιστορία της Φαρμακευτικής
2ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Ανόργανη Χημεία ΙΙ, Γενική Βοτανική, Οργανική Χημεία Ι, Στατιστικές Μέθοδοι, Βιολογία, Φυσιολογία Ι.
3ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Αναλυτική Χημεία Ι, Βιοχημεία, Οργανική Χημεία ΙΙ, Φυσιολογία ΙΙ Μαθήματα Επιλογής Επιλέγεται 1 Μάθημα
4ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Αναλυτική Χημεία ΙΙ, Φαρμακευτική Μικροβιολογία, Φυσικοχημεία Μαθήματα Επιλογής Επιλέγονται 2 Μαθήματα
5ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Φαρμακευτική Τεχνολογία Ι, Φαρμακευτική Χημεία Ι, Φαρμακογνωσία Ι, Φαρμακολογία Ι
Μαθήματα Επιλογής Επιλέγεται 1 Μάθημα
6ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Βιοφαρμακευτική, Τοξικολογία Ι, Φαρμακευτική Χημεία ΙΙ, Φαρμακολογία ΙΙ.
Μαθήματα Επιλογής Επιλέγεται 1 Μάθημα
7ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Τοξικολογία ΙΙ, Φαρμακευτική Ανάλυση Ι, Φαρμακευτική Τεχνολογία ΙΙ, Φαρμακευτική Χημεία ΙΙΙ, Φαρμακογνωσία ΙΙ.
8ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Υποχρεωτικά Μαθήματα Φαρμακευτική Ανάλυση ΙΙ, Φαρμακευτική Ραδιοχημεία, Φαρμακευτική Τεχνολογία ΙΙΙ, Φαρμακευτική Χημεία IV, Φαρμακογνωσία ΙΙΙ
9ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Α. Πτυχιακή Εργασία και 3 Μαθήματα Επιλογής ή
Β .Επιλέγονται 6 Μαθήματα Επιλογής
10ο ΕΞΑΜΗΝΟ
Α. Διπλωματική Εργασία
Β. Μαθήματα Επιλογής Επιλέγονται 3 Μαθήματα Επιλογής

Μαθήματα Επιλογής
Βασικές Αρχές Σχεδιασμού Φαρμάκων, Βιοτεχνολογία - Βιολογικοί Έλεγχοι, Διοίκηση Επιχειρήσεων – Marketing, Ειδικά Μαθήματα Φαρμακευτικής Ραδιοχημείας, Εισαγωγή στους Η/Υ – Προγραμματισμός, Έλεγχος και Αξιολόγηση Καλλυντικών Προϊόντων, Ιδιότητες και Εφαρμογές Εκδόχων, Κλινική Φαρμακοκινητική, Κλινική Χημεία, Μαθήματα Σχεδιασμού Φαρμακοτεχνικών Μορφών, Μεταβολισμός Φαρμάκων, Μοριακή Φαρμακολογία, Χημεία Τροφίμων – Διατροφή, Χημική Οικολογία - Θαλάσσια Φαρμακογνωσία Νεώτερα Φαρμακευτικά Συστήματα, Πρώτες Βοήθειες, Σταθερότητα Φαρμακευτικών Προϊόντων, Σύνθεση Φυσικών Προϊόντων, Φαρμακευτική Βοτανική, Τεχνικές Διαχωρισμού στη Φαρμακευτική Ανάλυση, Τεχνολογία Καλλυντικών – Κοσμητολογία, Υγιεινή – Επιδημιολογία, Φαρμακοκινητική, Φασματοσκοπία Φυσικών Προϊόντων, Φασματοσκοπικές Μέθοδοι στην Οργανική Χημεία, Φυτοθεραπευτική – Ομοιοπαθητική, Χημεία Ετεροκυκλικών Ενώσεων, Φαρμακοοικονομία

Σημείωση: Ο φοιτητής για να αποκτήσει το πτυχίο της Φαρμακευτικής θα πρέπει να εξεταστεί με επιτυχία σε 37 υποχρεωτικά μαθήματα και σε 11 μαθήματα επιλογής.