Το Τμήμα Κτηνιατρικής του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης ιδρύθηκε ως Κτηνιατρική Σχολή με τον Α.Ν. 1510/50, που επικυρώθηκε με το Ν. 1776/51. Σε εφαρμογή του Ν. 1268/82 η Κτηνιατρική Σχολή μετατράπηκε σε Τμήμα, ενώ με το Π.Δ. 130/83 συγκροτήθηκε η Σχολή Γεωτεχνικών Επιστημών, στην οποία εντάχθηκαν τα Τμήματα: α) Κτηνιατρικής, β) Γεωπονίας και γ) Δασολογίας και Φυσικού Περιβάλλοντος.
Το Τμήμα Κτηνιατρικής έχει τους εξής πέντε Τομείς: α) Δομής και Λειτουργίας Ζωικών Οργανισμών, β) Ζωικής Παραγωγής, Ιχθυολογίας, Οικολογίας και Προστασίας Περιβάλλοντος, γ) Λοιμωδών και Παρασιτικών Νοσημάτων, Παθολογίας Πτηνών και Παθολογικής Ανατομικής, δ) Υγιεινής και Τεχνολογίας Τροφίμων Ζωικής Προελεύσεως και ε) Κλινικών μικρών και μεγάλων ζώων.
Στην Κτηνιατρική Σχολή ιδρύθηκε, με το Π.Δ. 799/75, Τμήμα Μεταπτυχιακών σπουδών, με τις εξής ειδικεύσεις: α) Ζωοτεχνίας και Διατροφής Αγροτικών Ζώων, β) Τεχνολογίας Τροφίμων Ζωικής Προελεύσεως, γ) Υγιεινής Τροφίμων Ζωικής Προελεύσεως, δ) Τεχνητής Σπερματέγχυσης και Παθολογίας Αναπαραγωγής, ε) Πτηνοτροφίας και Παθολογίας Πτηνών, στ) Εκτροφής και Παθολογίας Χοίρων, ζ) Μικροβιολογίας και Λοιμωδών Νοσημάτων, η) Παρασιτολογίας και Παρασιτικών Νοσημάτων, θ) Παθολογικής Ανατομικής, ι) Κτηνιατρικής Παθολογίας και ια) Κτηνιατρικής Χειρουργικής. Από αυτές λειτούργησαν οι ειδικεύσεις της Υγιεινής Τροφίμων Ζωικής Προελεύσεως και της Μικροβιολογίας και Λοιμωδών Νοσημάτων, η λειτουργία τους όμως διακόπηκε το 1985, για λόγους υλικοτεχνικής ανεπάρκειας.
Από το Τμήμα Κτηνιατρικής χορηγείται ένα πτυχίο, μετά από σπουδές διάρκειας πέντε ετών (δέκα εξάμηνα), ενώ η Κτηνιατρική Σχολή χορήγησε και μεταπτυχιακά διπλώματα στις ειδικεύσεις που λειτούργησαν (βλ. παραπάνω).
Τα εργαστήρια του Τμήματος στεγάζονται σε κτίριο της Πανεπιστημιούπολης και οι Κλινικές σε συγκρότημα κτιρίων που βρίσκεται στην οδό Σταύρου Βουτυρά 11, στο δυτικό τμήμα της πόλης (κοντά στο νέο Σιδηροδρομικό Σταθμό).

Το ισχύον πρόγραμμα σπουδών, που άρχισε να εφαρμόζεται στους Πρωτοετείς της ακαδημαϊκής χρονιάς 1988-1989, οδηγεί τους φοιτητές του Τμήματος Κτηνιατρικής στη λήψη πτυχίου μετά από παρακολούθηση και επιτυχή εξέταση στα υποχρεωτικά μαθήματα, που αποτελούν τον "κορμό", και σε ένα αριθμό μαθημάτων επιλογής. Τα μαθήματα επιλογής, τα οποία διδάσκονται στο τελευταίο εξάμηνο σπουδών, εντάσσονται σε τρεις κατευθύνσεις: α) της "εκτροφής και παθολογίας παραγωγικών ζώων", β) της "υγιεινής και τεχνολογίας τροφίμων ζωικής προελεύσεως" και γ) της "κλινικής ζώων συντροφιάς". Οι φοιτητές πρέπει να διαλέξουν μια από τις τρεις αυτές κατευθύνσεις. Ειδικότερα, η κατεύθυνση της "εκτροφής και παθολογίας παραγωγικών ζώων" περιλαμβάνει μία κύρια ομάδα μαθημάτων για τα μηρυκαστικά, τα οποία πρέπει να παρακολουθήσουν υποχρεωτικά οι φοιτητές που έχουν διαλέξει την κατεύθυνση αυτή, αλλά και τρεις άλλες ομάδες μαθημάτων για τους χοίρους, τα πτηνά και τους ιχθύς, από τις οποίες πρέπει να διαλέξουν τη μία. Σε καθεμία από τις τρεις κατευθύνσεις οι φοιτητές εκπαιδεύονται για διάστημα που αντιστοιχεί σε 21 διδακτικές μονάδες .
Οι ακαδημαϊκές μονάδες ECTS (European Community Course Credit Transfer System) είναι η αριθμητική τιμή (από 1 έως 60) η οποία εκφράζει τον απαιτούμενο φόρτο εργασίας ενός φοιτητή για την επιτυχία του σε ένα μάθημα. Ειδικότερα, οι ακαδημαϊκές μονάδες αντικατοπτρίζουν την ποσότητα εργασίας που απαιτείται για την επιτυχή ολοκλήρωση κάθε μαθήματος σε σχέση με τη συνολική ποσότητα εργασίας που απαιτείται για την ολοκλήρωση ενός πλήρους ακαδημαϊκού έτους σπουδών στο ίδρυμα. Στην ποσότητα αυτή εργασίας περιλαμβάνονται η παρακολούθηση των παραδόσεων, η πρακτική εργασία, η κλινική άσκηση, τα σεμινάρια, τα φροντιστήρια, η επιτόπια έρευνα, η κατ' ιδίαν μελέτη στη βιβλιοθήκη ή η κατ' οίκον, καθώς και εξετάσεις ή άλλες διαδικασίες αξιολόγησης. Συμπερασματικά, το σύστημα αυτό αντικατοπτρίζει τον πλήρη φόρτο εργασίας ενός φοιτητή και δεν περιορίζεται μόνο στις ώρες παρακολούθησης του μαθήματος.
Η παρακολούθηση ορισμένων υποχρεωτικών μαθημάτων, αλλά και μαθημάτων επιλογής έχει ως προϋπόθεση την προηγούμενη επιτυχή λήψη (ελ), προηγούμενη ουσιαστική λήψη (ολ) ή προηγούμενη παρακολούθηση (ππ) άλλων μαθημάτων.
Στο νέο πρόγραμμα σπουδών οι ξένες γλώσσες διδάσκονται στα πρώτα έξι εξάμηνα. Ο μέσος όρος των βαθμών της ξένης γλώσσας στα έξι εξάμηνα αποτελεί τον τελικό βαθμό της, που λαμβάνεται υπόψη στον υπολογισμό του βαθμού πτυχίου.
Πριν από την έναρξη ενός εξαμήνου οι φοιτητές πρέπει να δηλώσουν τα υποχρεωτικά και τα μαθήματα επιλογής που επιθυμούν να παρακολουθήσουν κατά τη διάρκεια του εξαμήνου αυτού. Η δήλωση γίνεται στα εργαστήρια ή τις κλινικές, όπου διδάσκονται τα αντίστοιχα μαθήματα.

Υποχρεωτικά μαθήματα (μαθήματα "κορμού"):

Εξάμηνο 1ο
Φυσική, Χημεία, Μακροσκοπική ανατομική Ι, Στατιστική, Στοιχεία γενετικής, Εισαγωγή στην Κτηνιατρική επιστήμη-
Πειραματόζωα, Ξένη γλώσσα

Εξάμηνο 2ο
Μακροσκοπική ανατομική ΙΙ, Βιοχημεία, Οικολογία και προστασία περιβάλλοντος, Μικροσκοπική ανατομική Ι, Ζωολογία, Ξένη γλώσσα

Εξάμηνο 3ο
Μικροσκοπική ανατομική ΙΙ, Φυσιολογία Ι, Ζωοτεχνία Ι, Βασικές αρχές διατροφής , Μικροβιολογία Ι, Ξένη γλώσσα

Εξάμηνο 4ο
Φυσιολογία ΙΙ, Μικροβιολογία ΙΙ, Ανοσολογία, Ζωοτεχνία ΙΙ, Παρασιτολογία, Ζωοτροφές και σιτηρέσια, Οικονομία ζωικής παραγωγής, Ξένη γλώσσα

Εξάμηνο 5ο
Γενική παθολογία και προπαιδευτική Ι, Φαρμακολογία, Ζωοτεχνία ΙΙΙ, Γενική παθολογική ανατομική, Αρχές υγιεινής και τεχνολογίας του γάλα-κτος και των γαλακτοκομικών προϊ-όντων, Ιχθυολογία, υδατοκαλλιέργειες, ιχθυοπαθο-λο-γία, Ξένη γλώσσα

Εξάμηνο 6ο
Γενική παθολογία και προπαιδευτική ΙΙ, Ειδική παθολογική ανατομική Ι, Λοιμώδη νοσήματα Ι-Επιζωοτιολογία -Δημόσια Υγεία-Προληπτική Κτην/κή, Γενική και ειδική τεχνολογία τροφίμων ζωικής προελεύσεως, Μελισσοκομία και μελισσοπαθολογία, Τοξικολογία, Ξένη γλώσσα

Εξάμηνο 7ο
Παθολογία παραγωγικών ζώων Ι, Παθολογία ζώων συντροφιάς Ι, Χειρουργική Ι, Αναισθησιολογία, Λοιμώδη νοσήματα ΙΙ-Επιζωοτιολογία-Δημόσια Υγεία-Προληπτική Κτην/κή, Παρασιτικά νοσήματα - Επιζωοτιολογία-Δημόσια Υγεία-Προληπτική Κτην/κή, Μαιευτική Ι, Τεχνητή σπερματέγχυση, σύγχρονες μέθοδoι αναπαραγωγής

Εξάμηνο 8ο
Παθολογία παραγωγικών ζώων ΙΙ, Παθολογία ζώων συντροφιάς ΙΙ, Χειρουργική ΙΙ, Παθολογία αναπαραγωγής, Υγιεινή τροφίμων ζωικής προελεύσεως Ι, Παθολογία πτηνών Ι, Ειδική παθολογική ανατομική ΙΙ, Ακτινολογία, Κτηνιατρική δεοντολογία-Νομοθεσία

Εξάμηνο 9ο
Παθολογία παραγωγικών ζώων ΙΙΙ, Παθολογία ζώων συντροφιάς ΙΙΙ, Χειρουργική ΙΙI, Μαιευτική ΙΙ, Υγιεινή τροφίμων ζωικής προελεύσεως ΙΙ, Παθολογία πτηνών ΙΙ, Ειδική παθολογική ανατομική ΙΙΙ, Σεμινάριο στην ειδική τεχνολογία τροφίμων ζωικής προελεύσεως -

Εξάμηνo 10ο
Κατευθύνσεις

Ι. Εκτροφή και παθολογία παραγωγικών ζωών
(με υποκατευθύνσεις: Α+Β ή Α+Γ ή Α+Δ)

ΙΑ. Μηρυκαστικά: Εκτροφή μηρυκαστικών, Παθολογία μηρυκαστικών, Μαιευτική, φυσιοπαθολογία αναπαραγωγής
ΙΒ. Χοίροι: Εκτροφή Χοίρων, Παθολογία χοίρων
ΙΓ. Πτηνά: Εκτροφή πτηνών, Παθολογία πτηνών
ΙΔ. Ιχθύες: Υδάτινο περιβάλλον, Υδατοκαλλιέργειες, Ιχθυοπαθολογία

ΙΙ. Υγιεινή και τεχνολογία τροφίμων ζωικής προελεύσεως
Υγιεινή και τεχνολογία των γαλακτοκομικών προϊόντων, Ποιοτικός έλεγχος τροφίμων ζωικής προελεύσεως, Μικροβιολογία τροφίμων και σιτιογενείς διαταραχές της υγείας του ανθρώπου, Τοξικολογία τροφίμων, Τεχνολογία του κρέατος, των αλιευμάτων, των αυγών και των προϊόντων τους, Υγιεινή εργοστασίων επεξεργασίας τροφίμων, Υγιεινή του κρέατος, των αλιευμάτων, των αυγών και των προϊόντων τους, Σύγχρονες τάσεις και εφαρμογές στην υγιεινή και τεχνολογία τροφίμων ζωικής προελεύσεως (σεμινάριο)

ΙΙΙ. Κλινικές ζωών συντροφιάς
Εγχειρητική και ορθοπεδική χειρουργική. Παθήσεις των οφθαλμών, Αναισθησιολογία, Ακτινολογία, Ειδική παθολογία: νοσήματα του δέρματος και των ενδοκρινών αδένων, Ειδική παθολογία: νοσήματα του αναπνευστικού, του κυκλοφορικού και αιμοποιητικού συστήματος, Ειδική παθολογία: νοσήματα του πεπτικού και του ουροποιητικού συστήματος. Διαιτητικά σιτηρέσια, Ειδική παθολογία: νοσήματα του νευρικού και του κινητικού συστήματος, Μαιευτική και παθολογία αναπαραγωγής

Ασκήσεις: Στη διάρκεια του 10ου εξαμήνου γίνονται ασκήσεις (πέντε ομάδες) στις κλινικές, στο νεκροτομείο και σε μονάδες, ιδρύματα κ.τ.λ. για 5 ώρες την ημέρα τις 2 ημέρες και για 2 ώρες την ημέρα τις υπόλοιπες 3 ημέρες της εβδομάδας. Προϋπόθεση για τη συμμετοχή στις πρακτικές εξετάσεις του 10ου εξαμήνου είναι η επιτυχής λήψη των αντίστοιχων μαθημάτων των προηγούμενων εξαμήνων, πλην του 9ου εξαμήνου όπου αρκεί η προηγούμενη παρακολούθηση των μαθημάτων.