Η Σχολή με την επωνυμία Στρατιωτική Ιατρική Σχολή (ΣΙΣ) ιδρύθηκε στην Αθήνα το 1926 και λειτούργησε για 9 χρόνια μέχρι το 1935. Το 1937 επαναλειτούργησε ως Υγειονομικό Τμήμα της Σχολής Στρατιωτικών Υπηρεσιών (ΣΑΣΥ), η οποία διέκοψε τη λειτουργία της όταν κηρύχτηκε ο Β' Παγκόσμιος Πόλεμος. Μετά τη λήξη του πολέμου επανιδρύθηκε ως ΣΙΣ στη Θεσσαλονίκη. Το 1970 μετονομάσθηκε σε Στρατιωτική Σχολή Αξιωματικών Σωμάτων (ΣΣΑΣ) με την προσθήκη των τμημάτων του Δικαστικού, Στρατολογικού και Οικονομικού.


Αποστολή των τμημάτων Ιατρικής είναι η ανάδειξη επιστημόνων ικανών να ασχολούνται με την εφαρμογή μεθόδων για την πρόληψη, διάγνωση και θεραπεία των ασθενειών του ανθρώπου.

Τα μαθήματα κάθε έτος διδάσκονται σε 2 εξάμηνα. Η εκπαίδευση των φοιτητών γίνεται με τις θεωρητικές παραδόσεις των μαθημάτων, τις φροντιστηριακές ασκήσεις, τις εργαστηριακές ασκήσεις και τις κλινικές ασκήσεις. H φοίτηση είναι υποχρεωτική στις φροντιστηριακές, εργαστηριακές και κλινικές ασκήσεις ενώ δεν απαιτείται διπλωματική εργασία.

Εξάμηνο 1ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Ιατρική Βιολογία, Ιατρική Φυσική, Ιατρική Στατιστική, Ιατρική Πληροφορική Ι, Εισαγωγή στη Βιολογική Χημεία, Ανατομική Ι
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Ιατρικό Δίκαιο, Νομολογία, Δεοντολογία, Εισαγωγή στην Βιοϊατρική Τεχνολογία, Ξένη Γλώσσα Ι

Εξάμηνο 2ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Ιατρική Γενετική, Βιολογική Χημεία Ι, Γενική Φυσιολογία, Ιστορία Ιατρικής, Ιατρική Πληροφορική ΙΙ
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Ιατρική Ψυχολογία, Εφαρμογές Ιατρικής Πληροφορικής, Ξένη Γλώσσα ΙΙ

Εξάμηνο 3ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Βιολογική Χημεία ΙΙ, Ανατομική ΙΙ, Φυσιολογία Ι, Ιστολογία -Εμβρυολογία Ι, Ξενόγλωσση Ιατρική Ορολογία Ι
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Ψυχολογία Συμπεριφοράς, Θέματα Ιστορίας της Ιατρικής

Εξάμηνο 4ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Φυσιολογία ΙΙ, Ιστολογία -Εμβρυολογία ΙΙ, Ανατομική ΙΙΙ, Ξενόγλωσση Ιατρική Ορολογία Ι
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Λειτουργική Ανατομική, Κλινική Βιοχημεία, Κλινική Εμβρυολογία

Εξάμηνο 5ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Γενική Παθολογική Ανατομική, Μικροβιολογία - Ανοσολογία Ι, Υγιεινή, Φαρμακολογία Ι, Παθολογία Ι
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Εφαρμοσμένη Φυσιολογία, Βιοχημεία και Φυσιολογία Σωματικής ?σκησης, Παιδοψυχιατρική

Εξάμηνο 6ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Ειδική Παθολογική Ανατομική Ι, Φαρμακολογία ΙΙ, Κοινωνική Ιατρική, Χειρουργική Ι, Μικροβιολογία - Ανοσολογία ΙΙ
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Φυσική Ιατρική και Αποκατάσταση, Ανθρώπινη Αναπαραγωγή, Νευροπαθολογία

Εξάμηνο 7ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Χειρουργική ΙΙ, Αναισθησιολογία, Ιατροδικαστική - Τοξικολογία Ι, Απεικονιστική Διαγνωστική, Ουρολογία, ΩΡΛ, Ειδ. Παθολογική Ανατομική ΙΙ
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Μοριακή Φαρμακολογία, Εντατική Θεραπεία, Ανάνηψη, Θεραπευτική Του Πόνου

Εξάμηνο 8ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Νευρολογία, Ιατροδικαστική - Τοξικολογία ΙΙ, Επείγουσα Ιατρική - Α΄ Βοήθειες, Ορθοπεδική, Οφθαλμολογία, Παθολογική Φυσιολογία
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Αρχές Κλινικής Ανοσολογίας, Κλινική Μικροβιολογία, Ιατρική Εργασία, Νευροφυσιολογία και Κλινικές Εφαρμογές, Κλινική Φαρμακολογία, Θρομβοεμβολικές Παθήσεις

Εξάμηνο 9ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Παθολογία ΙΙ, Νευροχειρουργική, Δερματολογία - Αφροδισιολογία, Ψυχιατρική, Μαιευτική - Γυναικολογία Ι
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Γηριατρική - Γεροντολογία, Ενδονοσοκομειακές Λοιμώξεις, Παρεμβατική Ακτινολογία, Διαταραχές Επικοινωνίας, Αγγειοχειρουργική, Χειρουργικές Παθήσεις Θώρακα, Πλαστική Χειρουργική, Ειδικές Εφαρμογές Πυρηνικής Ιατρικής, Ακτινοθεραπευτική Ογκολογία

Εξάμηνο 10ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Παιδιατρική, Χειρουργική Παίδων, Μαιευτική - Γυναικολογία ΙΙ, Πνευμονολογία, Καρδιολογία
Μαθήματα Υποχρεωτικής Επιλογής: Παιδιατρική Νευρολογία, Αναπτυξιακή και Κοινωνική Παιδιατρική, Συμβουλευτική Γενετική, Επείγουσα Νευροχειρουργική, Μεταμοσχεύσεις Οργάνων - Ιστών, Εφαρμοσμένη Οφθαλμολογία, Παιδιατρική Καρδιολογία, Νεογνολογία, Καρδιοχειρουργική

Εξάμηνο 11ο & 12ο
Υποχρεωτικά Μαθήματα: Παθολογία, Χειρουργική, Μαιευτική - Γυναικολογία, Παιδιατρική, Νευρολογία, Ψυχιατρική

Διάρκεια σπουδών (εξάμηνα): 12
Κατευθύνσεις: Ειδικότητες
Υπάρχουν 37 επίσημα αναγνωρισμένες ειδικότητες, που χωρίζονται σε τρεις τομείς:
Α) Παθολογίας, Β) Χειρουργικής, Γ) Κλινικοεργαστηριακής και εργαστηριακής ιατρικής.

1. Αγγειοχειρουργική 2. Αιματολογία 3. Ακτινοδιαγνωστική 4. Ακτινοθεραπευτική-Ογκολογία 5. Αλλεργιολογία 6. Αναισθησιολογία 7. Γαστρεντερολογία 8. Γενική Ιατρική 9.Δερματολογία-Αφροδισιολογία 10. Ενδοκρινολογία 11. Ιατροδικαστική 12. Ιατρική Εργασίας 13. Καρδιολογία 14. Κοινωνική Ιατρική 15. Κυτταρολογία 16. Μαιευτική-Γυναικολογία 17. Μικροβιολογία (Ιατρική Βιοπαθολογία) 18. Νευρολογία 19. Νευροχειρουργική 20. Νεφρολογία 21. Ορθοπεδική 22. Ουρολογία 23. Οφθαλμολογία 24. Παθολογία 25. Παθολογοανατομία 26. Παιδιατρική 27. Παιδοψυχιατρική 28. Πλαστική-Επανορθωτ. Χειρουργική 29. Πνευμονολογία-Φυματιολογία 30. Πυρηνική Ιατρική 31. Ρευματολογία 32. Φυσική Ιατρική-Αποκατάσταση 33. Χειρουργική Θώρακος 34. Χειρουργική Παίδων 35. Χειρουργική 36. Ψυχιατρική 37. Ωτορινολαρυγγολογία